Turinys

• Programinės įrangos apžvalga
• Palaikomi failų tipai
• Pirminis failo plėtinys
• Kiti failų plėtiniai, naudojami „Integrated Genome Browser 9“

Versija (nuo 2016-06-29)	9
Platformos
Licencija	Atviro kodo
Kategorija	Mokslinis

Daugiau informacijos (apsilankykite leidėjo svetainėje)

Įvertinimas: 2.8 / 5 (6 balsai)

Programinės įrangos apžvalga

Pagrindinės funkcijos

• Palaiko įvairius genomo formatus, tokius kaip „GenBank“ ir „FASTA“
• Bendraukite su duomenimis su priartinimo ir panoraminių animacijų
• Pasiekite ir įkelkite genomus iš „QuickLoad“ svetainių
• Pakeiskite duomenis į įvairias grafiko formas
• Pasidalinkite duomenimis su bendradarbiais naudodami „Dropbox“
• Įdiekite papildomų funkcijų papildinius

Integruota genomo naršyklė (IGB) yra atviro kodo programa, naudojama didelių genominių duomenų rinkinių peržiūrai ir tyrimui. Galite peržiūrėti įvairius duomenų formatus, bendrauti su duomenimis, kurti diagramas, išsaugoti informaciją kaip vaizdus ir dalytis duomenimis su bendradarbiais.

IGB leidžia peržiūrėti duomenis iš anotacijų ir suderintų sekų. Programa palaiko įvairius formatus, tokius kaip FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband ir GenBank. Galite paimti duomenis ir paversti juos įvairiomis diagramų formomis, įskaitant neatitikimo grafikus, kad būtų parodyti duomenų skirtumai ir gylis grafikai, rodantys aprėptį. Taip pat galite bendrauti su duomenimis per IGB priartinimo ir panoraminių animacijų.

IGB leidžia jums pasiekti ir įkelti genomus iš QuickLoad svetainių, kurios yra paprastos katalogų, sekų ir kitų duomenų failų sistemos vizualizavimo tikslais. IGB suteikia papildomą funkciją su papildoma parama, kad būtų galima pridėti funkcionalumą ir darbo eigos automatizavimą naudojant scenarijus. IGB taip pat suteikia jums pažangias funkcijas, skirtas dalintis duomenimis, ar ji skelbia ją kaip aukštos kokybės JPEG, PNG arba SVG vaizdą, ar saugo duomenis „Dropbox“, kad jūsų bendradarbiai galėtų naudotis jūsų projektu.

IGB daugiausia naudoja universitetų mokslininkai, biologai ir bioinformatikai. Ji suteikia pažangias priemones, leidžiančias atverti įvairius genomo duomenų formatus, vizualizuoti duomenis kaip skirtingus grafikus ir dalintis duomenimis su bendradarbiais. Deja, programa remiasi dotacijomis tolesniam vystymuisi, o tai reiškia, kad paraiška paraiška gali būti nutraukta bet kuriuo metu. Tačiau „Integrated Genome Browser“ vis dar yra tinkama, pritaikoma programa, skirta vartotojams, norintiems ištirti ir analizuoti jų genomo duomenis.

Palaikomi failų tipai

Pirminis failo plėtinys

.XML - XML ​​failas

Kiti failų plėtiniai, naudojami „Integrated Genome Browser 9“

Palaikomi failų tipai
.BED	UCSC BED anotacijos takelio failas
.DAS	DeltaMaster analizės sesija
.FA	FASTA formatuotas sekos failas
.AS	FASTA sekos failas
.FASTA	FASTA sekos failas
.GB	„GenBank“ duomenų failas
.SGR	SGR genomo duomenų failas
.USEQ	USeq genomo duomenų failas